Лаборатория искусственного интеллекта и биоинформатики
О подразделении
Технологии искусственного интеллекта находят все более широкое применение в биологии и медицине. Лаборатория использует, адаптирует и разрабатывает собственные пайплайны для обработки биологических данных различных типов. Другим направлением работы лаборатории является системная биология. Технология позволяет смоделировать биологические процессы на различных уровнях – от клеточного до организменного. Модели системной биологии используют для проведения виртуальных экспериментов, что позволяет экономить время, расходные материалы, реактивы. Результаты исследований на моделях затем воспроизводят на клеточных моделях, подтверждая или опровергая выдвинутые гипотезы.
Руководитель лаборатории биоинформатики и искусственного интеллекта
Арбатский Михаил Спартакович, к.н.
Основные направления научных исследований
- Использование и адаптация под собственные задачи имеющихся вычислительных алгоритмов и инструментов.
- Разработка и усовершенствование собственных вычислительных алгоритмов и решений.
- Применение технологий искусственного интеллекта и нейросетей в вычислительных алгоритмах для повышения точности и производительности.
- Применение подхода системной биологии к решению рутинных задач с целью экономии времени расходных материалов и реактивов.
Основные публикации
- Chechekhin, V. Ivanova, A. Kulebyakin, K. Sysoeva, V. Naida, D. Arbatsky, M. Basalova, N. Karagyaur, M. Skryabina, M. Efimenko, A. et al. Alpha1A- and Beta3-Adrenoceptors Interplay in Adipose Multipotent Mesenchymal Stromal Cells: A Novel Mechanism of Obesity-Driven Hypertension. Cells 2023, 12, 585. https://doi.org/10.3390/cells12040585
- Khozyainova, A.A., Valyaeva, A.A., Arbatsky, M.S. et al. Complex Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data. Biochemistry Moscow 88, 231–252 (2023). https://doi.org/10.1134/S0006297923020074
- Grigorieva O, Basalova N, Vigovskiy M, Arbatskiy M, Dyachkova U, Kulebyakina M, Kulebyakin K, Tyurin-Kuzmin P, Kalinina N, Efimenko A. Novel Potential Markers of Myofibroblast Differentiation Revealed by Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Mesenchymal Stromal Cells in Profibrotic and Adipogenic Conditions. Biomedicines. 2023; 11(3):840. https://doi.org/10.3390/biomedicines11030840
- Voynova E, Kulebyakin K, Grigorieva O, Novoseletskaya E, Basalova N, Alexandrushkina N, Arbatskiy M, Vigovskiy M, Sorokina A, Zinoveva A, Bakhchinyan E, Kalinina N, Akopyan Z, Tkachuk V, Tyurin-Kuzmin P and Efimenko A (2022) Declined adipogenic potential of senescent MSCs due to shift in insulin signaling and altered exosome cargo. Front. Cell Dev. Biol. 10:1050489. doi: 10.3389/fcell.2022.1050489
- Arbatsky, M., Tyurin-Kuzmin, P., Kulebyakin, K. et al. Points of Significance: Principal Component Analysis for Biocentric Data Visualization. BioNanoSci. 12, 1366–1380 (2022). https://doi.org/10.1007/s12668-022-01021-w